腟鏡を用いて腟内と子宮頸部を調べます。少し違和感はあるかもしれませんが、通常、痛みは伴いません。若年の方(性交渉歴のない方）は、直腸から診察を行うこともあります。子宮の周囲に炎症や癒着を有するような場合には、内診によって痛みを覚えることがあるために、婦人科では重要な検査となります。

内診時に、腟内から分泌物のサンプルを採取します。スライドにサンプルを塗布し、顕微鏡を使用して分泌物を詳細に観察します。細菌、真菌、トリコモナス、淋菌などの有無を確認します。

内診時に、腟内から分泌物のサンプルを採取します。サンプルは特別な培地で培養されます。この培地には栄養が含まれており、温度を制御された場所で数日から数週間放置します。この間に微生物（細菌、淋菌など）が培地で成長し増殖します。培養容器を詳しく観察して、細菌などが増殖している場合には、その種類や数量を特定します。医師はこれらの結果を評価し、異常な細菌などの増殖や感染症の有無を診断します。

子宮頸部から細胞をブラシで軽くこすり取り、顕微鏡で検査します。悪性腫瘍（がん）の有無を確認します。年齢や症状、ホルモン検査結果によっては、体がん検査も追加します。

内診ではわからない、子宮内部や卵巣の形態上の異常がないか確認します。子宮や卵巣の異常、卵巣の腫れや嚢胞、子宮内膜の状態などを評価します。